掌握多种技能学习方法是培养强力队伍的核心。技能获取的基础途径主要包括宝可梦的自然升级与技能机器的使用。每只宝可梦在达到特定等级时会自动领悟预设的技能，这是最直接的方式。游戏中散落了大量一次性的技能机器和可重复使用的秘传机，它们通常隐藏在地图角落、作为道馆奖励或由特定NPC赠送，使用后能让兼容的宝可梦立即学会对应招式，极大丰富了技能搭配的可能性。
秘传技能在游戏中占据着特殊而关键的地位，它们不仅是战斗招式，更是推进剧情和探索地图的必备工具。这类技能需要通过完成特定的剧情线或任务来获取，例如帮助圣安奴号的船长以获得一字斩，或在图鉴收集一定数量后从博士助手处得到闪光术。秘传技能一旦学习便无法被常规手段遗忘，且需要获得相应的道馆徽章才能在大地图上使用，因此建议专门培养一只工具宠来集中学习这些技能，以优化主力队伍的技能格。
如果你对宝可梦已学会的技能搭配不满意，游戏也提供了修正的机会。技能回忆机制位于七之岛区域，找到技能回忆师并支付特定的树果作为代价，就能让宝可梦重新习得它曾经通过升级或机器掌握过、但已被遗忘的技能。游戏中还存在一些技能教学NPC，他们分布在各个城镇，可以教授一些无法通过技能机器获得的特殊招式，与这些NPC充分互动是收集全技能的重要一环。
